MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 63413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	TTCC	2	8	48	55	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018227	TCT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018227	CTT	2	6	97	102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018227	AT	3	6	122	127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018227	TAT	2	6	161	166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018227	TGCA	2	8	176	183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018227	ATC	3	9	198	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018227	CCA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018227	TCA	3	9	273	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018227	TCT	2	6	300	305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018227	TCCTG	2	10	397	406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018227	CAT	2	6	424	429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
13	NC_018227	GCCC	2	8	583	590	0 %	0 %	25 %	75 %	397779167
14	NC_018227	CAA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397779167
15	NC_018227	CGGGA	2	10	634	643	20 %	0 %	60 %	20 %	397779167
16	NC_018227	GC	3	6	690	695	0 %	0 %	50 %	50 %	397779167
17	NC_018227	GATA	2	8	739	746	50 %	25 %	25 %	0 %	397779167
18	NC_018227	CGA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
19	NC_018227	CCGA	2	8	845	852	25 %	0 %	25 %	50 %	397779167
20	NC_018227	TCA	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
21	NC_018227	CGA	2	6	916	921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
22	NC_018227	AAG	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779167
23	NC_018227	GCG	2	6	945	950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779167
24	NC_018227	CT	3	6	957	962	0 %	50 %	0 %	50 %	397779167
25	NC_018227	CAT	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
26	NC_018227	TCCTC	2	10	1062	1071	0 %	40 %	0 %	60 %	397779167
27	NC_018227	AGG	2	6	1080	1085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
28	NC_018227	TCCC	2	8	1095	1102	0 %	25 %	0 %	75 %	397779167
29	NC_018227	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
30	NC_018227	AG	3	6	1137	1142	50 %	0 %	50 %	0 %	397779167
31	NC_018227	GCG	2	6	1196	1201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779167
32	NC_018227	AGG	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
33	NC_018227	TCC	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779167
34	NC_018227	TGG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779167
35	NC_018227	GGT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779167
36	NC_018227	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
37	NC_018227	CCG	2	6	1501	1506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779167
38	NC_018227	TCA	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
39	NC_018227	GTC	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779167
40	NC_018227	CGA	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
41	NC_018227	CAAG	2	8	1614	1621	50 %	0 %	25 %	25 %	397779167
42	NC_018227	GAG	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
43	NC_018227	TCA	2	6	1632	1637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
44	NC_018227	CGA	2	6	1654	1659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
45	NC_018227	TCC	3	9	1735	1743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779168
46	NC_018227	GCT	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
47	NC_018227	GGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779168
48	NC_018227	CAG	2	6	1829	1834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779168
49	NC_018227	GGC	2	6	1841	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779168
50	NC_018227	CCG	2	6	1856	1861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779168
51	NC_018227	CGG	2	6	1867	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779168
52	NC_018227	TCG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
53	NC_018227	GGCA	2	8	1889	1896	25 %	0 %	50 %	25 %	397779168
54	NC_018227	GATCG	2	10	1956	1965	20 %	20 %	40 %	20 %	397779168
55	NC_018227	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397779168
56	NC_018227	CTG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
57	NC_018227	GCAT	2	8	2053	2060	25 %	25 %	25 %	25 %	397779168
58	NC_018227	ATC	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779168
59	NC_018227	TGAGG	2	10	2205	2214	20 %	20 %	60 %	0 %	397779168
60	NC_018227	TCC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
61	NC_018227	TTC	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779169
62	NC_018227	GGA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
63	NC_018227	GAG	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
64	NC_018227	ATC	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779169
65	NC_018227	GCG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
66	NC_018227	GGC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
67	NC_018227	TGT	2	6	2542	2547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397779169
68	NC_018227	CGA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
69	NC_018227	TCGC	2	8	2609	2616	0 %	25 %	25 %	50 %	397779169
70	NC_018227	CGG	2	6	2617	2622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
71	NC_018227	CGG	2	6	2743	2748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
72	NC_018227	AGG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
73	NC_018227	CCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
74	NC_018227	CCT	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
75	NC_018227	CGA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
76	NC_018227	CGG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
77	NC_018227	GC	3	6	2958	2963	0 %	0 %	50 %	50 %	397779169
78	NC_018227	CGG	2	6	2979	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
79	NC_018227	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397779169
80	NC_018227	GCG	2	6	3038	3043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
81	NC_018227	TCG	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779169
82	NC_018227	AAAC	2	8	3130	3137	75 %	0 %	0 %	25 %	397779169
83	NC_018227	CTC	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
84	NC_018227	AGC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
85	NC_018227	GTC	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779169
86	NC_018227	AAG	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779169
87	NC_018227	T	6	6	3416	3421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018227	CT	3	6	3429	3434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018227	CGG	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018227	GCC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018227	GGA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018227	TCT	2	6	3753	3758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018227	TTGC	2	8	3790	3797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018227	CGG	2	6	3823	3828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018227	CGGT	2	8	3839	3846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018227	TCG	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018227	GTG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018227	GGC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018227	GTT	2	6	4048	4053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018227	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018227	ACT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018227	C	6	6	4287	4292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_018227	TCC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018227	CTA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018227	CTGTT	2	10	4395	4404	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018227	CAC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018227	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018227	TTTG	2	8	4527	4534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018227	GAA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018227	GTCCGG	2	12	4579	4590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018227	CG	3	6	4617	4622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018227	CG	3	6	4732	4737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018227	GGCC	2	8	4787	4794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018227	GGT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018227	TCC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018227	GA	3	6	4920	4925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018227	CGG	2	6	4986	4991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779171
118	NC_018227	C	6	6	5005	5010	0 %	0 %	0 %	100 %	397779171
119	NC_018227	GCG	2	6	5020	5025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779171
120	NC_018227	TAT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397779170
121	NC_018227	CGG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
122	NC_018227	CCAT	2	8	5219	5226	25 %	25 %	0 %	50 %	397779170
123	NC_018227	GCG	2	6	5238	5243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
124	NC_018227	GCG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
125	NC_018227	TCG	2	6	5358	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
126	NC_018227	AGG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779170
127	NC_018227	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
128	NC_018227	GCGGT	2	10	5428	5437	0 %	20 %	60 %	20 %	397779170
129	NC_018227	AAG	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779170
130	NC_018227	GGCA	2	8	5556	5563	25 %	0 %	50 %	25 %	397779170
131	NC_018227	ACG	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779170
132	NC_018227	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779170
133	NC_018227	CTC	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779170
134	NC_018227	CGC	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779170
135	NC_018227	CGA	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779170
136	NC_018227	TCG	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
137	NC_018227	GAG	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779170
138	NC_018227	CCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779170
139	NC_018227	GAT	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397779170
140	NC_018227	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779170
141	NC_018227	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779172
142	NC_018227	CTG	3	9	6193	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779172
143	NC_018227	GAG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779172
144	NC_018227	CCT	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779172
145	NC_018227	CCG	2	6	6330	6335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018227	CCG	2	6	6356	6361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779173
147	NC_018227	ATC	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779173
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151	NC_018227	TCT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779173
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153	NC_018227	CGG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779173
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220	NC_018227	GCCC	2	8	8749	8756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
221	NC_018227	GTG	2	6	8774	8779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_018227	GCG	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779176
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232	NC_018227	CGTC	2	8	9456	9463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
233	NC_018227	C	7	7	9468	9474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
234	NC_018227	GGA	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_018227	CAC	2	6	9534	9539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
237	NC_018227	TCA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779177
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262	NC_018227	AG	4	8	10682	10689	50 %	0 %	50 %	0 %	397779178
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264	NC_018227	CGC	2	6	10703	10708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779178
265	NC_018227	G	6	6	10743	10748	0 %	0 %	100 %	0 %	397779178
266	NC_018227	CGT	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779178
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270	NC_018227	GAA	2	6	10928	10933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779178
271	NC_018227	GGC	2	6	10980	10985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779179
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275	NC_018227	CGCC	2	8	11088	11095	0 %	0 %	25 %	75 %	397779179
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279	NC_018227	GA	3	6	11413	11418	50 %	0 %	50 %	0 %	397779181
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399	NC_018227	GTC	2	6	16029	16034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779187
400	NC_018227	TCC	2	6	16051	16056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779187
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402	NC_018227	TTC	2	6	16065	16070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779187
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497	NC_018227	CTA	2	6	20123	20128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779192
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499	NC_018227	ATG	2	6	20266	20271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397779192
500	NC_018227	CGA	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779192

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